國立自然科學博物館開館以來一直在研究、展示上與世界各國的學術單位多有合作，在112年擬定本館新的博物館使命後，本館更積極推動博物館走向國際，並於科學發展傳播中心下成立全球事務小組，尋求更多的合作管道，努力推動在研究、展示與典藏管理上與國際各單位合作的機會。 日本國立科學博物館成立於 1877 年，是日本歷史最悠久的博物館之一，也是日本國內唯一的國家科學博物館，更是代表日本的專一綜合科學博物館，且其在研究與蒐藏管理架構上與本館多有相似之處，故112年本館開始積極與日本國立科學博物館聯繫合作的各種可能性，後談定於本(113)年簽訂姊妹館合作協議書，而開啟本次的簽約暨參訪行程。