本會基於當前兩岸關係之和平發展，積極規劃擴大辦理與大陸蒙族聚居地區各項交流合作，其中公衛醫療與文化教育為本會當前重點工作。鑑於以往與內蒙古自治區在醫衛與文教領域上有良好交流，擬將「內蒙古經驗」擴大用於大陸其他蒙族聚居地區，促進兩岸更廣泛交流合作，102年派員赴大陸新疆地區洽談103年新的交流合作計畫，包括衛生醫療、教育文化、大專學生互訪交流等合作事宜。